الرئيسية التحكم التسجيل
 

 
 
العودة   منتديات الكيمياء الحيوية للجميع > الكيمياء الحيوية > الاحمــاض النـووية - Nucleic Acids
 
 

الاحمــاض النـووية - Nucleic Acids DNA- RNAs

إضافة رد
 
 
 
أدوات الموضوع انواع عرض الموضوع
 
 
 
 
قديم 02-22-2007, 11:05 AM   #1
ملكــة الصــمت
[عضو شرف]
 
الصورة الرمزية ملكــة الصــمت

 









ملكــة الصــمت غير متواجد حالياً
Messenger3 DNA Repair Mechanisms

i liked to write mechanisms in separate topic
cause i wanna subjects be short
and then more capable to be read

Just engoy


look the previous subject


DNA Repair

DNA Repair MechanismsThere are three major DNA repairing mechanisms:
base excision, nucleotide excision and mismatch repair.



Base excision
DNA's bases may be modified by deamination or alkylation. The position of the modified (damaged) base is called the "abasic site" or "AP site". In E.coli, the DNA glycosylase can recognize the AP site and remove its base. Then, the AP endonuclease removes the AP site and neighboring nucleotides. The gap is filled by DNA polymerase I and DNA ligase.



Nucleotide excision
In E. coli, proteins UvrA, UvrB, and UvrC are involved in removing the damaged nucleotides (e.g., the dimer induced by UV light). The gap is then filled by DNA polymerase I and DNA ligase. In yeast, the proteins similar to Uvr's are named RADxx ("RAD" stands for "radiation"), such as RAD3, RAD10. etc.



Mismatch repair
To repair mismatched bases, the system has to know which base is the correct one. In E. coli, this is achieved by a special methylase called the "Dam methylase", which can methylate all adenines that occur within (5')GATC sequences. Immediately after DNA replication, the template strand has been methylated, but the newly synthesized strand is not methylated yet. Thus, the template strand and the new strand can be distinguished.



The repairing process begins with the protein MutS which binds to mismatched base pairs. Then, MutL is recruited to the complex and activates MutH which binds to GATC sequences. Activation of MutH cleaves the unmethylated strand at the GATC site. Subsequently, the segment from the cleavage site to the mismatch is removed by exonuclease (with assistance from helicase II and SSB proteins). If the cleavage occurs on the 3' side of the mismatch, this step is carried out by exonuclease I (which degrades a single strand only in the 3' to 5' direction). If the cleavage occurs on the 5' side of the mismatch, exonuclease VII or RecJ is used to degrade the single stranded DNA. The gap is filled by DNA polymerase III and DNA ligase.

The distance between the GATC site and the mismatch could be as long as 1,000 base pairs. Therefore, mismatch repair is very expensive and inefficient.

Mismatch repair in eukaryotes may be similar to that in E. coli. Homologs of MutS and MutL have been identified in yeast, mammals, and other eukaryotes. MSH1 to MSH5 are homologous to MutS; MLH1, PMS1 and PMS2 are homologous to MutL. Mutations of MSH2, PMS1 and PMS2 are related to colon cancer.

In eukaryotes, the mechanism to distinguish the template strand from the new strand is still unclear.



من مواضيع ملكــة الصــمت في المنتدى

التوقيع


After great experience with different relations
..
I realize

always family comes first

اتخرجناااااااااااااااااااااااااااااااااا


[glow=FF3366]لا اله الا انت سبحانك اني كنت من الظالمين ...[/glow]
   
رد مع اقتباس
 
 
 
 
قديم 02-22-2007, 11:09 AM   #2
ملكــة الصــمت
[عضو شرف]
 
الصورة الرمزية ملكــة الصــمت

 









ملكــة الصــمت غير متواجد حالياً
افتراضي Review Articles

Review Articles:

Cellular machineries for chromosomal DNA repair - Genes and Development, 2004.

The discovery of a new family of mammalian enzymes for repair of oxidatively damaged DNA, and its physiological implications - Carcinogenesis, 2003.

Nucleotide excision repair and chromatin remodeling - European J. Biochem., 2002.

Sensing and repairing DNA double-strand breaks - Carcinogenesis, 2002.

Base excision repair in a network of defence and tolerance - Carcinogenesis, 2001.

DNA Damage Control by Novel DNA Polymerases: Translesion Replication and Mutagenesis - J. Biol. Chem., 2001.

Roles for Mismatch Repair Factors in Regulating Genetic Recombination - Molecular and Cellular Biology, 2000.

Interactions of DNA Helicases with Damaged DNA: Possible Biological Consequences - J. Bio. Chem., 2000.

Molecular mechanism of nucleotide excision repair - Genes and Development, 1999

Recombinational Repair of DNA Damage in Escherichia coli and Bacteriophage l - Microbiology and Molecular Biology Reviews, 1999.




من مواضيع ملكــة الصــمت في المنتدى

   
رد مع اقتباس
 
 
 
 
قديم 02-22-2007, 02:18 PM   #4
ملكــة الصــمت
[عضو شرف]
 
الصورة الرمزية ملكــة الصــمت

 









ملكــة الصــمت غير متواجد حالياً
افتراضي

اقتباس:
المشاركة الأصلية كتبت بواسطة نايف مشاهدة المشاركة
كنا بجامعة الملك سعود ندرس مادتين عن الانزايم ميكانزم


لك الشكر ملكه
سمعت الدراسة عندكم بسعود نااااااااااااار

والشكر لمرورك ...



من مواضيع ملكــة الصــمت في المنتدى

   
رد مع اقتباس
 
 
 
 
قديم 02-23-2007, 02:46 AM   #5
yaak
ضيف

 






افتراضي

مشكوره ملكة الصمت على الموضوع الرائع

فعلا عندنا ماده اربع ساعات تتحدث عن الانزيمات وماده ثانيه فقط تتحدث عن ميكانيكية الانزيمات

اضافه الى مادتين بيولوجيه ... في جامعة الملك سعود

وبالنسبه لنار ... فهو نار بس الله ينجينا من نار جهنم

وعلى قولتهم مافيه شي بالسهل

مشكوره على الموضوع

وكنت اضفت صوره في موضوع سابق لك عن DNA REPAIR
وراح اضيفها هنا

لان اتوقع ان الموضوع مكمل لبعض



شكرا



من مواضيع yaak في المنتدى

   
رد مع اقتباس
 
 
 
 
قديم 02-23-2007, 02:57 AM   #6
ملكــة الصــمت
[عضو شرف]
 
الصورة الرمزية ملكــة الصــمت

 









ملكــة الصــمت غير متواجد حالياً
افتراضي

أخوي ياك ..
فعلا الموضوعين متكاملين
بس فصلتهم في موضوعين عشان السبب اللي ذكرته ...

مشكور لتواجدك اخوي ...



من مواضيع ملكــة الصــمت في المنتدى

   
رد مع اقتباس
 
 
 
 
قديم 03-07-2008, 11:44 PM   #7
hgf'g
بيوكيميائي جديد

 









hgf'g غير متواجد حالياً
افتراضي رد: DNA Repair Mechanisms

جزاكم الله خير أ




   
رد مع اقتباس
 
 
إضافة رد


الذين يشاهدون محتوى الموضوع الآن : 1 ( الأعضاء 0 والزوار 1)
 
أدوات الموضوع
انواع عرض الموضوع

تعليمات المشاركة
لا تستطيع إضافة مواضيع جديدة
لا تستطيع الرد على المواضيع
لا تستطيع إرفاق ملفات
لا تستطيع تعديل مشاركاتك

BB code is متاحة
كود [IMG] متاحة
كود HTML معطلة

الانتقال السريع

المواضيع المتشابهه
الموضوع كاتب الموضوع المنتدى مشاركات آخر مشاركة
mismatch repair mechanism جــود الفلاشات الكيميائية 9 08-12-2007 01:56 PM
DNA Repair ملكــة الصــمت الاحمــاض النـووية - Nucleic Acids 13 02-24-2007 03:02 AM
DNA Metabolism yaak الاحمــاض النـووية - Nucleic Acids 5 02-19-2007 05:44 AM



الساعة الآن 07:34 AM


Powered by vBulletin® Version 3.8.7
Copyright ©2000 - 2021, vBulletin Solutions, Inc.
يوتك